MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 3151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002682	TCG	2	6	37281	37286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488410
502	NC_002682	GCC	2	6	37313	37318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488410
503	NC_002682	CGG	2	6	37351	37356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488410
504	NC_002682	GCG	2	6	37463	37468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488410
505	NC_002682	CCA	2	6	37517	37522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488410
506	NC_002682	GTAGG	2	10	37599	37608	20 %	20 %	60 %	0 %	13488410
507	NC_002682	TGC	2	6	37613	37618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488410
508	NC_002682	CATG	2	8	37619	37626	25 %	25 %	25 %	25 %	13488410
509	NC_002682	GGC	2	6	37634	37639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488410
510	NC_002682	AAC	3	9	37656	37664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488410
511	NC_002682	AAC	2	6	37711	37716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488410
512	NC_002682	GAG	2	6	38170	38175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488412
513	NC_002682	TCG	2	6	38189	38194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488412
514	NC_002682	GC	3	6	38216	38221	0 %	0 %	50 %	50 %	13488412
515	NC_002682	GGC	2	6	38325	38330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488412
516	NC_002682	CGC	2	6	38364	38369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488412
517	NC_002682	GAT	2	6	38421	38426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488412
518	NC_002682	CGG	2	6	38451	38456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488412
519	NC_002682	TCA	2	6	38464	38469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488412
520	NC_002682	AGG	2	6	38473	38478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488412
521	NC_002682	TC	3	6	38543	38548	0 %	50 %	0 %	50 %	13488412
522	NC_002682	CAGCA	2	10	38567	38576	40 %	0 %	20 %	40 %	13488412
523	NC_002682	CTT	2	6	38634	38639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488413
524	NC_002682	TGG	2	6	38717	38722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488413
525	NC_002682	CAC	2	6	38760	38765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488413
526	NC_002682	CTC	2	6	38822	38827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488413
527	NC_002682	TGG	2	6	38828	38833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488413
528	NC_002682	CAC	2	6	38883	38888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488413
529	NC_002682	GCC	2	6	39398	39403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488414
530	NC_002682	GGCG	2	8	39441	39448	0 %	0 %	75 %	25 %	13488414
531	NC_002682	CCG	2	6	39481	39486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488414
532	NC_002682	CGCA	2	8	39550	39557	25 %	0 %	25 %	50 %	13488414
533	NC_002682	CCATG	2	10	39572	39581	20 %	20 %	20 %	40 %	13488414
534	NC_002682	CGG	2	6	39590	39595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488414
535	NC_002682	TGG	2	6	39604	39609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488414
536	NC_002682	ACA	2	6	39652	39657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488414
537	NC_002682	CGCC	2	8	39664	39671	0 %	0 %	25 %	75 %	13488414
538	NC_002682	GGC	2	6	39696	39701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488415
539	NC_002682	GC	3	6	39776	39781	0 %	0 %	50 %	50 %	13488415
540	NC_002682	AAG	2	6	39846	39851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488415
541	NC_002682	GTA	2	6	39881	39886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488416
542	NC_002682	GTC	2	6	39890	39895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488416
543	NC_002682	CG	3	6	39952	39957	0 %	0 %	50 %	50 %	13488416
544	NC_002682	GCG	2	6	39961	39966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488416
545	NC_002682	TGG	2	6	39967	39972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488416
546	NC_002682	CCG	2	6	40038	40043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488416
547	NC_002682	CGA	2	6	40054	40059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488416
548	NC_002682	GCC	2	6	40064	40069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488416
549	NC_002682	GCC	2	6	40073	40078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488416
550	NC_002682	GAG	2	6	40079	40084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488416
551	NC_002682	GGT	2	6	40091	40096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488416
552	NC_002682	GCT	2	6	40102	40107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488416
553	NC_002682	TCA	2	6	40147	40152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488416
554	NC_002682	CGG	2	6	40156	40161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488416
555	NC_002682	GTGC	2	8	40460	40467	0 %	25 %	50 %	25 %	13488417
556	NC_002682	TCGA	2	8	40508	40515	25 %	25 %	25 %	25 %	13488417
557	NC_002682	TCG	2	6	40566	40571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488417
558	NC_002682	GCC	2	6	40614	40619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
559	NC_002682	ACG	2	6	40797	40802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488417
560	NC_002682	GCA	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488417
561	NC_002682	GCG	2	6	40948	40953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488417
562	NC_002682	AAT	2	6	41029	41034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488417
563	NC_002682	GCC	2	6	41047	41052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
564	NC_002682	GCG	2	6	41142	41147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488417
565	NC_002682	TCG	2	6	41319	41324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488417
566	NC_002682	GCC	2	6	41399	41404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
567	NC_002682	CGC	2	6	41455	41460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
568	NC_002682	CCG	2	6	41471	41476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
569	NC_002682	GCC	2	6	41539	41544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
570	NC_002682	TCATG	2	10	41650	41659	20 %	40 %	20 %	20 %	13488417
571	NC_002682	CCT	2	6	41668	41673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488417
572	NC_002682	GCC	3	9	41770	41778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488417
573	NC_002682	CGA	2	6	41809	41814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488417
574	NC_002682	AGA	2	6	42150	42155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488418
575	NC_002682	TGA	3	9	42197	42205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488418
576	NC_002682	CA	3	6	42269	42274	50 %	0 %	0 %	50 %	13488418
577	NC_002682	GC	3	6	42284	42289	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
578	NC_002682	C	6	6	42289	42294	0 %	0 %	0 %	100 %	13488418
579	NC_002682	TCC	2	6	42312	42317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488418
580	NC_002682	TGG	2	6	42476	42481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488418
581	NC_002682	CTG	2	6	42541	42546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488418
582	NC_002682	TTG	2	6	42680	42685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488418
583	NC_002682	CAGC	2	8	42686	42693	25 %	0 %	25 %	50 %	13488418
584	NC_002682	T	6	6	42697	42702	0 %	100 %	0 %	0 %	13488418
585	NC_002682	GTG	2	6	42727	42732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488418
586	NC_002682	GC	3	6	42742	42747	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
587	NC_002682	TCA	2	6	42794	42799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488418
588	NC_002682	TAGG	2	8	42802	42809	25 %	25 %	50 %	0 %	13488418
589	NC_002682	CCA	2	6	42949	42954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488419
590	NC_002682	GCT	2	6	43689	43694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488420
591	NC_002682	GCC	2	6	43700	43705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488420
592	NC_002682	GAT	2	6	43862	43867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488420
593	NC_002682	TCG	2	6	44002	44007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488421
594	NC_002682	ATG	2	6	44032	44037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488421
595	NC_002682	CAG	2	6	44085	44090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488421
596	NC_002682	AGC	2	6	44107	44112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488421
597	NC_002682	GCTG	2	8	44122	44129	0 %	25 %	50 %	25 %	13488421
598	NC_002682	GTC	2	6	44153	44158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488421
599	NC_002682	CGC	3	9	44258	44266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488422
600	NC_002682	CGGCG	2	10	44284	44293	0 %	0 %	60 %	40 %	13488422
601	NC_002682	CGA	2	6	44362	44367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488422
602	NC_002682	TGAC	2	8	44680	44687	25 %	25 %	25 %	25 %	13488423
603	NC_002682	GCG	2	6	44728	44733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488423
604	NC_002682	GGT	2	6	45790	45795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488424
605	NC_002682	GTT	2	6	45827	45832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488424
606	NC_002682	GGTGAC	2	12	45850	45861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488424
607	NC_002682	AAG	2	6	45932	45937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488424
608	NC_002682	CGA	2	6	45946	45951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488424
609	NC_002682	GGC	2	6	46253	46258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488425
610	NC_002682	AACC	2	8	46324	46331	50 %	0 %	0 %	50 %	13488425
611	NC_002682	GCG	2	6	46347	46352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488425
612	NC_002682	AGA	2	6	48912	48917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488426
613	NC_002682	GTC	2	6	49046	49051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488426
614	NC_002682	CCGC	2	8	49102	49109	0 %	0 %	25 %	75 %	13488426
615	NC_002682	GCC	2	6	49137	49142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488426
616	NC_002682	AT	3	6	49159	49164	50 %	50 %	0 %	0 %	13488426
617	NC_002682	ATC	2	6	49181	49186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488426
618	NC_002682	GAT	2	6	49192	49197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488426
619	NC_002682	CTGG	2	8	49724	49731	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
620	NC_002682	TGA	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488427
621	NC_002682	GCCGA	2	10	49742	49751	20 %	0 %	40 %	40 %	13488427
622	NC_002682	TCGG	2	8	49768	49775	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
623	NC_002682	GGCT	2	8	49789	49796	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
624	NC_002682	AGC	2	6	49820	49825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488427
625	NC_002682	TCG	2	6	49832	49837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488427
626	NC_002682	AGC	2	6	49842	49847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488427
627	NC_002682	TCG	2	6	49866	49871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488427
628	NC_002682	CGC	2	6	49898	49903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488427
629	NC_002682	GCTG	2	8	50247	50254	0 %	25 %	50 %	25 %	13488428
630	NC_002682	TGCG	2	8	50672	50679	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
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632	NC_002682	GCTG	2	8	50783	50790	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
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733	NC_002682	GCGG	2	8	59746	59753	0 %	0 %	75 %	25 %	13488441
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745	NC_002682	ATC	2	6	60254	60259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488441
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753	NC_002682	CG	3	6	60703	60708	0 %	0 %	50 %	50 %	13488442
754	NC_002682	CAG	3	9	60756	60764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488442
755	NC_002682	CCAT	2	8	60776	60783	25 %	25 %	0 %	50 %	13488442
756	NC_002682	ATGTCG	2	12	60794	60805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13488442
757	NC_002682	CAAC	2	8	60942	60949	50 %	0 %	0 %	50 %	13488442
758	NC_002682	CTCCA	2	10	62594	62603	20 %	20 %	0 %	60 %	13488443
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760	NC_002682	GT	3	6	62643	62648	0 %	50 %	50 %	0 %	13488443
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887	NC_002682	CGG	2	6	74254	74259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488453
888	NC_002682	GTA	2	6	74381	74386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488453
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